1987年,长春应化所成立“中国科学院长春应用化学研究所开发总公司”,作为研究办产业实体的管理机构。
       1989年,原开发总公司改组为“中国科学院长春应用化学科技总公司”,时任中国科学院院长卢嘉锡亲自题写公司名称。
       1994年,筹建了“长春热缩股份有限公司”(以下简称“长春热缩”)。 1995年6月25日,江泽民总书记亲自视察长春热缩并题词:“搞好热缩材料生产,发展高新技术产业。”
       1997年10月7日,长春热缩股票在上海挂牌上市,成为中科院第一家所办上市公司。
       2002年-2005年,根据科学院产业政策调整,先后完成研究所和公司下属10余家企业的股权社会化改革工作。
       2004年,浙江海正集团有限公司等共同出资组建了“浙江海正生物材料股份有限公司”,建有国内第一条、世界第二条自主知识产权的万吨级聚乳酸产业化生产线。
       2009年,启动高新北区中试、孵化园区建设。
       2011年,筹建“浙江中科应化科技有限公司”、“哈尔滨应用化学工程中心”。
       2013年,筹建“吉林省中科应化化工新材料孵化器有限公司”。
       2014年,获首批国家知识产权局“知识产权运营示范机构”支持。
       2016年,筹建了“吉林省中科应化盈智知识产权运营有限责任公司”。
       2019年12月,公司重新设立了董事会,对运营结构和体系进行了系统调整。
       2020年,四个产业化项目纳入公司运营体系,实行事业部管理;通过了GB、GJB质量管理体系认证。
       2021年10月,科技总公司完成公司化改制,由全民所有制企业改制为国有独资有限责任公司,并更名为“中科应化(长春)科技有限公司”;11月,通过国家高新技术企业认定。
       2022年,参股企业“浙江海正生物材料股份有限公司”在上交所科创板上市;完成“浙江中科应化科技有限公司”股权交割和检测公司重组;国家发改委“三年行动计划”完成验收;根据省委主要领导的指示,启动“重大疾病和传染病体外诊断创新技术中心”建设,当年实现主体完工。
       未来,公司将进一步加大事业部和控股企业运营的整合力度,启动“五年上市”行动计划,初步实现协同项目横向整合,事业部和控股企业销售收入稳步增长;“重大疾病和传染病体外诊断创新技术中心”投入运行,打通核酸检测试剂生产全流程,实现2类产品应用;建立所内成果转化资金遴选机制,支持2-3个具有市场前景的中试项目;持续加大与政府相关部门、长春新区精细化工园的联动力度,立足“自主创新”,服务“科技引资”,积极引入自主原创技术,着力创新合作模式,破解转化“痛点”,全力推动研究所应用成果实现规模产业化,助推属地相关产业的发展。